Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad18Q9QXK2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rad18Q9QXK2 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rad18Q9QXK2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rad18Q9QXK2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rad18Q9QXK2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rad18Q9QXK2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rad18Q9QXK2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms