Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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