Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms