Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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