Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tgm1Q9JLF6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tgm1Q9JLF6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tgm1Q9JLF6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tgm1Q9JLF6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tgm1Q9JLF6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tgm1Q9JLF6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tgm1Q9JLF6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms