Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gde1Q9JL56 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gde1Q9JL56 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gde1Q9JL56 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gde1Q9JL56 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gde1Q9JL56 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Gde1Q9JL56 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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