Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Hmgn5Q9JL35 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Hmgn5Q9JL35 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms