Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms