Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim39Q9ESN2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms