Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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