Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Aff4Q9ESC8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Aff4Q9ESC8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Aff4Q9ESC8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Aff4Q9ESC8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Aff4Q9ESC8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Aff4Q9ESC8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Aff4Q9ESC8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Aff4Q9ESC8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Aff4Q9ESC8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Aff4Q9ESC8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Aff4Q9ESC8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Aff4Q9ESC8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Aff4Q9ESC8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Aff4Q9ESC8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Aff4Q9ESC8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Aff4Q9ESC8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Aff4Q9ESC8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Aff4Q9ESC8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Aff4Q9ESC8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Aff4Q9ESC8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Aff4Q9ESC8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Aff4Q9ESC8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aff4Q9ESC8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aff4Q9ESC8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aff4Q9ESC8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aff4Q9ESC8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aff4Q9ESC8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aff4Q9ESC8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Aff4Q9ESC8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aff4Q9ESC8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aff4Q9ESC8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aff4Q9ESC8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aff4Q9ESC8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aff4Q9ESC8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Aff4Q9ESC8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Aff4Q9ESC8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aff4Q9ESC8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms