Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp29Q9ES63 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp29Q9ES63 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp29Q9ES63 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp29Q9ES63 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp29Q9ES63 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp29Q9ES63 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp29Q9ES63 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp29Q9ES63 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp29Q9ES63 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp29Q9ES63 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp29Q9ES63 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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