Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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