Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfcp2Q9ERA0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms