Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pop7Q9DCH2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pop7Q9DCH2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pop7Q9DCH2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pop7Q9DCH2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pop7Q9DCH2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pop7Q9DCH2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pop7Q9DCH2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pop7Q9DCH2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pop7Q9DCH2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pop7Q9DCH2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pop7Q9DCH2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pop7Q9DCH2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pop7Q9DCH2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pop7Q9DCH2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pop7Q9DCH2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pop7Q9DCH2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pop7Q9DCH2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pop7Q9DCH2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pop7Q9DCH2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pop7Q9DCH2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pop7Q9DCH2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pop7Q9DCH2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pop7Q9DCH2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms