Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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