Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms