Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms