Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ift43Q9DA69 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ift43Q9DA69 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ift43Q9DA69 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ift43Q9DA69 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ift43Q9DA69 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ift43Q9DA69 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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