Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms