Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms