Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930449I24RikQ9D5E3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms