Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc83Q9D4V3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms