Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgms2Q9D4B1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgms2Q9D4B1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sgms2Q9D4B1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms