Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms