Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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