Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag1Q9D3E6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag1Q9D3E6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag1Q9D3E6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag1Q9D3E6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag1Q9D3E6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag1Q9D3E6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag1Q9D3E6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag1Q9D3E6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stag1Q9D3E6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stag1Q9D3E6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stag1Q9D3E6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stag1Q9D3E6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stag1Q9D3E6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stag1Q9D3E6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stag1Q9D3E6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stag1Q9D3E6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms