Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms