Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Tmem53Q9D0Z3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Tmem53Q9D0Z3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem53Q9D0Z3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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