Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CYI0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CYI0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CYI0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CYI0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms