Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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