Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms