Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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