Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms