Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PsenenQ9CQR7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms