Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms