Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Atp6v0e1Q9CQD8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Atp6v0e1Q9CQD8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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