Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms