Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp2Q9CQ73 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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