Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Chmp3Q9CQ10 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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Chmp3Q9CQ10 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Chmp3Q9CQ10 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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Chmp3Q9CQ10 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Chmp3Q9CQ10 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Chmp3Q9CQ10 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Chmp3Q9CQ10 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Chmp3Q9CQ10 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Chmp3Q9CQ10 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Chmp3Q9CQ10 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Chmp3Q9CQ10 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Chmp3Q9CQ10 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Chmp3Q9CQ10 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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