Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms