Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms