Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cntnap4Q99P47 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cntnap4Q99P47 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cntnap4Q99P47 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cntnap4Q99P47 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cntnap4Q99P47 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cntnap4Q99P47 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cntnap4Q99P47 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cntnap4Q99P47 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cntnap4Q99P47 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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