Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms