Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE9

Pbx4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx4Q99NE9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pbx4Q99NE9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pbx4Q99NE9 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pbx4Q99NE9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pbx4Q99NE9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbx4Q99NE9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbx4Q99NE9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbx4Q99NE9 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbx4Q99NE9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbx4Q99NE9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbx4Q99NE9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pbx4Q99NE9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pbx4Q99NE9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pbx4Q99NE9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbx4Q99NE9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbx4Q99NE9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbx4Q99NE9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbx4Q99NE9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbx4Q99NE9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbx4Q99NE9 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbx4Q99NE9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbx4Q99NE9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbx4Q99NE9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbx4Q99NE9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbx4Q99NE9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbx4Q99NE9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbx4Q99NE9 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx4Q99NE9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx4Q99NE9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx4Q99NE9 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx4Q99NE9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx4Q99NE9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pbx4Q99NE9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms