Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Hdac9Q99N13 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Hdac9Q99N13 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Hdac9Q99N13 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Hdac9Q99N13 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Hdac9Q99N13 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Hdac9Q99N13 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Hdac9Q99N13 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Hdac9Q99N13 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Hdac9Q99N13 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Hdac9Q99N13 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Hdac9Q99N13 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Hdac9Q99N13 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Hdac9Q99N13 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Hdac9Q99N13 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms