Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms