Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms