Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms