Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms